‎Anggota KP VI-2002 Muara Kubu melaksanakan patroli perairan untuk menjaga keamanan dan ketertiban di wilayah perairan. Patroli ini bertujuan untuk mencegah kegiatan ilegal seperti penangkapan ikan secara ilegal, penyelundupan barang ilegal, dan aktivitas kriminal lainnya yang dapat mengancam keamanan dan keselamatan di perairan.
‎
‎Selain itu, patroli ini juga dilakukan untuk memastikan keselamatan navigasi, membantu kapal yang mengalami masalah, serta memberikan perlindungan dan penegakan hukum di wilayah perairan dan memberi rasa aman kepada masyarakat pesisir yang sedang beraktifitas mencegah terjadinya gangguan Kamtibmas.
